溯本求源，兵器工业卫生研究所（五二一医院）是由中国人民解放军成都军区七一二野战医院成建制集体转业而组建起来的。

1975年，组建成立“第五机械工业部第二十研究院西安第一职工医院”；1976年1月组建筹建处并对外办公。

1978年，启用“第五机械工业部第二十研究院五二一医院”名称。

1982年，五二一医院改建为“兵器工业部职业病防治院”并附设“兵器工业部卫生研究所”。

1983年，下达了”关于兵器工业部职业病防治院实施方案”，确定了院（所）的机构设置及职工总数。

1984年，兵器工业部职业病防治院（兵器工业卫生研究所）召开了开院（所）大会；门诊科室对外开诊。

1987年增设100张床位，共开设病床200张。标志着院（所）从建院阶段转入以科研、医疗为重点的新阶段。

1987年，国家机械工业委员会将“兵器工业部职业病防治院”（兵器工业部卫生研究所）更名为“国家机械工业委员会工业卫生研究所”。

1988年，机械电子工业部将“国家机械工业委员会工业卫生研究所”更名为“机械电子工业部工业卫生研究所”。

1990年，中国兵器工业总公司将我院（所）定名为“兵器工业卫生研究所”（兵器工业五二一医院）。

1990年，兵器工业卫生研究所（兵器工业五二一医院）定为副局级。

1998年，经集团公司批准为正局级单位。

2000年，中国兵器工业集团公司改组成立后，我所第二所名为中国兵器工业第521研究所。